More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05936 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  967    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  83.82 
 
 		 476 aa  788    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  65 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.42 
 
 		 478 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  59.88 
 
 		 488 aa  551  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.08 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.83 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 484 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 484 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 		 484 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.89 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 		 484 aa  338  9e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.29 
 
 		 481 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.32 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 		 479 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.78 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 		 505 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 		 505 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 		 502 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 506 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  37.4 
 
 		 505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 500 aa  282  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  38.26 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  33.06 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 		 626 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 640 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 634 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 		 634 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 640 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.6 
 
 		 712 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  36.1 
 
 		 545 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 		 564 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 715 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.63 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.82 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  37.26 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 		 713 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.25 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.23 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 637 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 		 634 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 		 643 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 572 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  35.4 
 
 		 628 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.78 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 		 646 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.8 
 
 		 626 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  35.8 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  37.76 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.61 
 
 		 626 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 		 557 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  34.82 
 
 		 626 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 640 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 544 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  31.69 
 
 		 578 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.74 
 
 		 561 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.9 
 
 		 638 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 638 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  32.96 
 
 		 633 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  35.82 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 628 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 638 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 714 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 		 772 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  36.65 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 640 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  39.85 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>