More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1827 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.14 
 
 		 506 aa  892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.54 
 
 		 505 aa  869    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  82.18 
 
 		 505 aa  840    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 502 aa  1008    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.32 
 
 		 504 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.94 
 
 		 506 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.94 
 
 		 506 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  69.74 
 
 		 500 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.15 
 
 		 505 aa  869    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.72 
 
 		 501 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.15 
 
 		 505 aa  869    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.14 
 
 		 506 aa  893    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.87 
 
 		 500 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.82 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  39.72 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  38.52 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 484 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  38.82 
 
 		 480 aa  292  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  36.66 
 
 		 473 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 479 aa  279  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 		 479 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 482 aa  276  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 		 482 aa  276  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  46.27 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 482 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  38.77 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 478 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  36.85 
 
 		 488 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 		 479 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 533 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 		 533 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.17 
 
 		 533 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  39.18 
 
 		 536 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 		 634 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 		 533 aa  193  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 713 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.71 
 
 		 634 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 		 640 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.75 
 
 		 559 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.81 
 
 		 638 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 637 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 638 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  37.07 
 
 		 629 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 		 638 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  33.68 
 
 		 629 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 541 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  31.58 
 
 		 629 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  38.76 
 
 		 623 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 		 539 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  38.44 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 546 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  33.25 
 
 		 629 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  35.9 
 
 		 629 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  37.68 
 
 		 712 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  37.39 
 
 		 712 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 625 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  36.22 
 
 		 632 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  36.03 
 
 		 546 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.7 
 
 		 773 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  39.08 
 
 		 623 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  36.18 
 
 		 640 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.18 
 
 		 628 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.81 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 		 622 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.18 
 
 		 628 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 830 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  35.9 
 
 		 632 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.2 
 
 		 623 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.67 
 
 		 624 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.37 
 
 		 624 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.62 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 668 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 639 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 658 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  33.9 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.99 
 
 		 630 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  37.69 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>