More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0713 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 473 aa  956    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  65 
 
 		 480 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  64.42 
 
 		 476 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.11 
 
 		 478 aa  594  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.67 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  56.64 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.78 
 
 		 479 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 484 aa  335  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 481 aa  335  9e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.67 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 		 484 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 482 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 479 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  37.3 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 506 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.98 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.85 
 
 		 506 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 467 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  38.03 
 
 		 472 aa  259  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  36.98 
 
 		 467 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.3 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 568 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 541 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 626 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38 
 
 		 541 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  35.84 
 
 		 712 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  35.12 
 
 		 554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 713 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 640 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.54 
 
 		 712 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  40.07 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 554 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 554 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  36.74 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 		 554 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  40.07 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 		 716 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 554 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.91 
 
 		 714 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.03 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 568 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.91 
 
 		 714 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  34.08 
 
 		 697 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 		 636 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  37.26 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.39 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.78 
 
 		 626 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.5 
 
 		 634 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 555 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 		 554 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.19 
 
 		 634 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33 
 
 		 634 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  32.33 
 
 		 641 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 554 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 554 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  41.13 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  34.19 
 
 		 543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 572 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  31.36 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.67 
 
 		 626 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>