More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003409 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  90.58 
 
 		 472 aa  818    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 467 aa  937    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  50.96 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 		 501 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 		 505 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 		 505 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  40.67 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.88 
 
 		 505 aa  339  8e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  39.65 
 
 		 476 aa  276  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  38.33 
 
 		 480 aa  276  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  37.53 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.05 
 
 		 482 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 488 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 478 aa  261  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 		 484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 		 484 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.09 
 
 		 479 aa  256  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 		 484 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 482 aa  249  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 484 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 484 aa  242  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 479 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  36.2 
 
 		 628 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 634 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 		 653 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 630 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  35 
 
 		 634 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 630 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 653 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 		 626 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  41.89 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  36.66 
 
 		 630 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 		 543 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  36.18 
 
 		 628 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  37.96 
 
 		 538 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  38.49 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 		 630 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  38.16 
 
 		 536 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 630 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 630 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 630 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.38 
 
 		 630 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 620 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  36.17 
 
 		 639 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 773 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  34.14 
 
 		 543 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.59 
 
 		 623 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 548 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.91 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 631 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.47 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  36.01 
 
 		 627 aa  163  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2528  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 		 665 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 645 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 674 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 568 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  35.47 
 
 		 633 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 653 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.05 
 
 		 630 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  32 
 
 		 645 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  40.96 
 
 		 540 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 620 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  38.51 
 
 		 557 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 667 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 630 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 		 637 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  37.77 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  34.51 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 667 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 674 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>