More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2422 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 484 aa  976    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.95 
 
 		 484 aa  839    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.16 
 
 		 484 aa  839    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.64 
 
 		 484 aa  798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.29 
 
 		 482 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.85 
 
 		 484 aa  801    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.54 
 
 		 484 aa  829    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.64 
 
 		 484 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.16 
 
 		 484 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.71 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.98 
 
 		 481 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.29 
 
 		 479 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.15 
 
 		 482 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.84 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  64.73 
 
 		 481 aa  555  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  42.27 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  42.59 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  41.63 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43 
 
 		 479 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 		 479 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  39.88 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.08 
 
 		 504 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  41.99 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.8 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 500 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  39.52 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 502 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 499 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 505 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  45.29 
 
 		 472 aa  246  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  36.52 
 
 		 467 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  36.11 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 467 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3045.2  methyl-accepting chemotaxis protein  71.71 
 
 		 152 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 564 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.84 
 
 		 646 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 533 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  30.71 
 
 		 653 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 541 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 713 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 		 541 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 552 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 552 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.07 
 
 		 634 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.69 
 
 		 712 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 542 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  37.96 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.69 
 
 		 712 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 620 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 634 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 		 636 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  33.7 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.17 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.2 
 
 		 673 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 716 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 541 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 541 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 		 634 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 527 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 620 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 638 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  34.45 
 
 		 557 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  38.28 
 
 		 672 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 527 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 638 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.69 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 		 638 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.36 
 
 		 639 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  32.37 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 673 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 673 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 634 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  34.59 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 538 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>