More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1664 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.77 
 
 		 482 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.88 
 
 		 484 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.5 
 
 		 484 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000872044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.5 
 
 		 484 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2947  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.46 
 
 		 482 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.5 
 
 		 484 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0806929  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 482 aa  966    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.587548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.09 
 
 		 484 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19262  hitchhiker  0.00019204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1442  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.67 
 
 		 484 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.67 
 
 		 484 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.01 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.29 
 
 		 484 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.54 
 
 		 481 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.83 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  61.95 
 
 		 481 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  41.86 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  41.63 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.87 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1954  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 		 504 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.39 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0481837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 488 aa  316  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 		 479 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  39.3 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.04 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  39.92 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.9 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 505 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1906  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 		 506 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00117287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  39.17 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 506 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.72 
 
 		 506 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1899  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 506 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000132488  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.1 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003409  methyl-accepting chemotaxis protein  39.05 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000050033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  38.92 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4500  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 467 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 527 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 637 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 527 aa  193  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 619 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  35.58 
 
 		 643 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 		 646 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.78 
 
 		 527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 		 640 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 527 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 629 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 		 638 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 638 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 638 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 630 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 541 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 630 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 640 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  37.03 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  32.32 
 
 		 653 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 		 653 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.08 
 
 		 634 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 638 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  35.19 
 
 		 639 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 630 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 541 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 541 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  38.85 
 
 		 672 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 		 633 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 541 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 634 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  36 
 
 		 647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34 
 
 		 541 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  36.71 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.03 
 
 		 630 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 653 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.03 
 
 		 630 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 679 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  35.14 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  35.38 
 
 		 647 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 638 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.28 
 
 		 634 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 		 636 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 637 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  37.22 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  33.99 
 
 		 568 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>