More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1122 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
396 aa  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1491  chemotaxis sensory transducer  32.64 
 
 
393 aa  190  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000901619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.88 
 
 
566 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
566 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
664 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
664 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
564 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
657 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.51 
 
 
880 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.52 
 
 
565 aa  106  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.327894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  48.2 
 
 
447 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.15 
 
 
660 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
674 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 
660 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 
604 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2356  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.14 
 
 
415 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.120093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
566 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00481169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 
553 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.68 
 
 
521 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.95 
 
 
499 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2726  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 
319 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00330308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 
505 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 
676 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  36.41 
 
 
521 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
545 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.45 
 
 
644 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 
541 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.96 
 
 
639 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2451  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 
655 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.932747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
479 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.36 
 
 
521 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
393 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.64 
 
 
659 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
650 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  35.33 
 
 
521 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
647 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
638 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 
639 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.98 
 
 
830 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 
661 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 
526 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2764  chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 
310 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0417253  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 
656 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 
544 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 
638 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 
762 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
542 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
393 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 
808 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.12 
 
 
639 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.65 
 
 
639 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.04 
 
 
543 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1832  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.51 
 
 
373 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.230567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
638 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0989  methyl-accepting chemotaxis protein  34.95 
 
 
689 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
638 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
507 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
528 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
525 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  50.47 
 
 
548 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
538 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
670 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
666 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
639 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  38.31 
 
 
628 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
546 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  39.58 
 
 
544 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
668 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
568 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000211004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 
579 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
667 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 
541 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 
541 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
541 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
273 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  44.64 
 
 
638 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3093  methyl-accepting chemotaxis protein  34.95 
 
 
576 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2237  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
661 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.551171  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
674 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
533 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
667 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  37.01 
 
 
628 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  41.35 
 
 
557 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.57 
 
 
627 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.65 
 
 
676 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  36.84 
 
 
549 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
636 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  39.57 
 
 
541 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
525 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.71 
 
 
748 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1600  chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
538 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00759873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 
564 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 
676 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.479493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  48.72 
 
 
626 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  35.68 
 
 
521 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
541 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.68 
 
 
521 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 
537 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0789  chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
676 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.54 
 
 
570 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>