More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2764 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2764  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
310 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0417253  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 
674 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
693 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  40.99 
 
 
650 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  38.86 
 
 
660 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  38.86 
 
 
660 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  38.86 
 
 
660 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 
660 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 
762 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 
650 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  37.08 
 
 
650 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 
626 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0201  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 
736 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00388216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 
540 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4766  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  48.51 
 
 
438 aa  106  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.63 
 
 
636 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 
543 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.05 
 
 
543 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 
543 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.62 
 
 
440 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  38.65 
 
 
544 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 
543 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
492 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 
492 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  0.000000143908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 
543 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  40.64 
 
 
493 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
543 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 
492 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 
492 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
658 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 
629 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  37.22 
 
 
529 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
543 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
830 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
543 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.81 
 
 
701 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.92 
 
 
552 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  35.14 
 
 
658 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.1 
 
 
658 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 
396 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 
660 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 
660 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 
572 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0355909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3414  methyl-accepting chemotaxis transducer/sensory box protein  42.21 
 
 
439 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  40.41 
 
 
658 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  40.41 
 
 
658 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4882  methyl-accepting chemotaxis protein  41.13 
 
 
580 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
691 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
731 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
601 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  50 
 
 
717 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.87 
 
 
633 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3916  putative chemotaxis transducer  39.6 
 
 
440 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
440 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.803806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.84 
 
 
626 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  41.43 
 
 
658 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 
639 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2348  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 
440 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0401397  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
580 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0442  methyl-accepting chemotaxis protein  41.13 
 
 
580 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
440 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  40.85 
 
 
658 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46030  putative chemotaxis transducer  39.33 
 
 
417 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0779  methyl-accepting chemotaxis transducer/sensory box protein  45.99 
 
 
446 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 
686 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 
660 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
438 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0800012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  33.79 
 
 
660 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.18 
 
 
765 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  39.73 
 
 
658 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 
660 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.56 
 
 
439 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 
671 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
541 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.56 
 
 
439 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255481  normal  0.0913013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0818  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.99 
 
 
438 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  40.41 
 
 
658 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 
650 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 
528 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  40.41 
 
 
658 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  40.41 
 
 
658 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
514 aa  99.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0140  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.9 
 
 
432 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452677  hitchhiker  0.00953212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1008  methyl-accepting chemotaxis protein  42.57 
 
 
466 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  37.74 
 
 
660 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03655  putative chemotaxis transducer  38.65 
 
 
438 aa  99.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
423 aa  99.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  35.11 
 
 
628 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
598 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
700 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
745 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.71 
 
 
599 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
564 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001528  putative chemotaxis transducer  36.36 
 
 
437 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 
641 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
733 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 
745 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 
630 aa  99  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2636  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
486 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>