More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0207 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 666 aa  1340    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 673 aa  287  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 674 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 674 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 673 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 673 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 673 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 		 673 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 673 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2472  methyl-accepting chemotaxis protein  30.17 
 
 		 661 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.07 
 
 		 673 aa  253  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 		 672 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 673 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  39.59 
 
 		 674 aa  248  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 675 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2237  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 		 661 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.551171  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 673 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  32.56 
 
 		 673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 673 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0986  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 		 673 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.603679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  30.23 
 
 		 674 aa  238  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 		 675 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  29.86 
 
 		 663 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  30.34 
 
 		 672 aa  231  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 658 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  31.27 
 
 		 663 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  39.32 
 
 		 712 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  39.32 
 
 		 712 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 638 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 637 aa  219  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 688 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 715 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 		 640 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  41.08 
 
 		 714 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 716 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  41.08 
 
 		 714 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.23 
 
 		 688 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.44 
 
 		 653 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 		 712 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 		 688 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.94 
 
 		 559 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 637 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 552 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  35.75 
 
 		 653 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 		 714 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 632 aa  205  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 		 568 aa  205  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.73 
 
 		 679 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 		 638 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 638 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  36.71 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 638 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 678 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 640 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 564 aa  201  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.63 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 714 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 675 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 639 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 639 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 		 674 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 639 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  39.58 
 
 		 647 aa  197  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 544 aa  197  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 634 aa  196  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 738 aa  196  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 		 541 aa  196  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  37.39 
 
 		 633 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  37.34 
 
 		 647 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 		 773 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 560 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.12 
 
 		 714 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 739 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 714 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 619 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 647 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 647 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 		 639 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  36.67 
 
 		 539 aa  193  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 547 aa  193  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.19 
 
 		 540 aa  193  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 638 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 677 aa  193  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 624 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  38.15 
 
 		 529 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 639 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>