More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5075 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5075  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  872    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.411558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  51.26 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3819  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3932  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.152264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 474 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4992  major facilitator superfamily MFS_1  49 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.942252  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.44 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4804  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 		 522 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 486 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.77 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 468 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 458 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1879  major facilitator family transporter  34.61 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0465  major facilitator superfamily permease  34.61 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.883476  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 520 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1425  putative methylenomycin A resistance protein  34.61 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2189  putative methylenomycin A resistance protein  34.61 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.969114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0562  major facilitator superfamily permease  34.38 
 
 		 514 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 		 489 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2073  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  34.31 
 
 		 561 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132683  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.17 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.88 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 463 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.11 
 
 		 583 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.44 
 
 		 485 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 519 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.61 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  36.61 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  37.07 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 509 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 488 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 		 539 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 492 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 525 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.19 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.96 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 534 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 		 487 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.61 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.665432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  34.96 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.52 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.15 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.78 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 		 541 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 		 505 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.61 
 
 		 476 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>