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for query gene Vapar_4992 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4992  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 457 aa  866    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.942252  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  67.86 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4168  major facilitator transporter  68.14 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.55276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3932  major facilitator superfamily MFS_1  60.86 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.152264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3819  major facilitator superfamily MFS_1  60.86 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5226  major facilitator transporter  57.33 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2892  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5075  major facilitator superfamily MFS_1  48.01 
 
 		 453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.411558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4804  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.196214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 480 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.07 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.52 
 
 		 502 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.49 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 489 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 469 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 484 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 478 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 508 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0100  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.41 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 507 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 512 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  33.73 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.05 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5313  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 542 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  31.44 
 
 		 523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.41 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 522 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 504 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.7 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 523 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 474 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 506 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.24 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 538 aa  163  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 540 aa  163  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4620  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 		 469 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 503 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
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NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
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NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  36.72 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 475 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4907  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.000355174 
 
 
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NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 		 763 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
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NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
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