More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4776 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  88.33 
 
 		 377 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  100 
 
 		 377 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  59.32 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  69.75 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  51.48 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  51.48 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  52.23 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  53.39 
 
 		 388 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  52.75 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  44.76 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  48.6 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  45.68 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  44.83 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  45.04 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  44.23 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  45.13 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  42.59 
 
 		 409 aa  262  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  42.54 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  41.1 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  41.6 
 
 		 385 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  41.87 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.46 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  43.38 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  41.53 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  42.42 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  44.04 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  40.55 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  43.73 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  43.73 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  44.29 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  42.61 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  41 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  42.19 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  40.96 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  41.05 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  43.1 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  44.1 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  40 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  41.1 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  40.22 
 
 		 413 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  42.82 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  39.89 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  39.77 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  39.48 
 
 		 342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  38.67 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.06 
 
 		 342 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  38.5 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  39.78 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  39.23 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.76 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  36.87 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  35.65 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  38.7 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  39.61 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  37.08 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  37.08 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  37.07 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  36.8 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.22 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.88 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.87 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  38.53 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.15 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.08 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.15 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.97 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  35.57 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.73 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  37.15 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.05 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.69 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.89 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  32.42 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.05 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  35.04 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  30.67 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  30.83 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  35.99 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  37.57 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.21 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.03 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  33.33 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  31.61 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  37.15 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  35.04 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  35.96 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  35.96 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  32.96 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.87 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  34.17 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  36.59 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  35.62 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.33 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.7 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  36.03 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.52 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.06 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  33.88 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>