More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1208 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  100 
 
 		 366 aa  737    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  44.1 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  48.6 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  42.98 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  45.96 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  45.89 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  45.61 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  42.05 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  42.05 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  46.39 
 
 		 374 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  45.77 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  41.05 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  42.55 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  44.66 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  42.32 
 
 		 377 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.35 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  43.49 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  41.18 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  42.39 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  41.03 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  42.39 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  43.38 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  43.02 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  40.42 
 
 		 408 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  42.41 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  43.09 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  39.24 
 
 		 389 aa  245  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  40.72 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  43.1 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  43.21 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  41.14 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  43.22 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  42.98 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  42.98 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  42.02 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  39.58 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  39.51 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  38.1 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  41.76 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  39.24 
 
 		 388 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  42.06 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  41.6 
 
 		 349 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  43.45 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  42.72 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  39.24 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  40.6 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  43.68 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  39.45 
 
 		 423 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  39.46 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  37.57 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  37.29 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  36.34 
 
 		 358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  35.96 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  37.46 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2818  alanine racemase  38.66 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2441  alanine racemase  38.66 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  34.6 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  40.07 
 
 		 294 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.38 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  36.01 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.08 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  33.24 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  33.24 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  33.07 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  33.7 
 
 		 364 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  33.61 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  34.99 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  35.18 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.33 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  33.96 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  36.71 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  33.7 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  33.51 
 
 		 383 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  33.51 
 
 		 383 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  33.51 
 
 		 383 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  34.26 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  35.36 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.06 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  33.52 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  33.52 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  33.52 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  33.52 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  33.52 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  35.03 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1460  alanine racemase  33.15 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0782  alanine racemase  32.63 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.804762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.8 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  32.14 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  33.7 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0958  alanine racemase  32.25 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  32.39 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  31.82 
 
 		 411 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  31.87 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  32.45 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>