More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2595 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  100 
 
 		 364 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  77.75 
 
 		 370 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  66.86 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  66.86 
 
 		 342 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  65.92 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  68.32 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  52.51 
 
 		 394 aa  351  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  53.93 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  50.14 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  51.96 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  51.96 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  50.27 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  50.7 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  50.42 
 
 		 409 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  50.7 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  45.78 
 
 		 373 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  45.94 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  44.84 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  44.69 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  46.56 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  46.05 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  51 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  42.9 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  47.62 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  46.95 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  47.78 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  42.86 
 
 		 396 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  46.65 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  48.74 
 
 		 377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  42.86 
 
 		 396 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  43.6 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  47.11 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  38.61 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  44.57 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  43.05 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  49.16 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  41.6 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  45.45 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.02 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  41.62 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  42.06 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  42.06 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.81 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  41.21 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  43.3 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  39.55 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  42.22 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  39.83 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  40.33 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  43.54 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  39.27 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  38.44 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  35.64 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  37.88 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  35.85 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  32.33 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  36.77 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.95 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  38.46 
 
 		 357 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  34.5 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  38.2 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.33 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  37.6 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  30.96 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  37.74 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  35 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  32.7 
 
 		 364 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  38.02 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  32.96 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  36.67 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  31.09 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  34.99 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  34.55 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.52 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  35.62 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  33.15 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.44 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  32.6 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  36.07 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  32.6 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  30.53 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  32.6 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  36.41 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.73 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  32.6 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.97 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  32.6 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.34 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  31.59 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  31.06 
 
 		 365 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  34.63 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  33.89 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  31.54 
 
 		 834 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  31.01 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  32.21 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  31.51 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  33.15 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  30.73 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  29.75 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  34.78 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>