More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0986 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  100 
 
 		 389 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  54.05 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  53.76 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  52.59 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  54.32 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  47.07 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  48.23 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  47.17 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  47.04 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  46.28 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  42.93 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  42.59 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  44.05 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  39.45 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  42.52 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  43.62 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  46.95 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  43.2 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  43.97 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  43.94 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  42.01 
 
 		 374 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  43.94 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  45.58 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  45.95 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  43.32 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  45.58 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  45.01 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  41.79 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  44.89 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  45.45 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  42.47 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  40.43 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  40.36 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  40.1 
 
 		 396 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  43.13 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  42.48 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  39.58 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  40.43 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  43.47 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  40 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  43.24 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  44.26 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  41.49 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  39.15 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  40.8 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  40.8 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  40.91 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  40.16 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  42.36 
 
 		 348 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  41.92 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  45.13 
 
 		 294 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  36.22 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  38.4 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  35.14 
 
 		 358 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  34.86 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  35.14 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  35.14 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.63 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  35.03 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  33.24 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  34.59 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  35.05 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.29 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.28 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  35.66 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  36.8 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  34.05 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.22 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  37.73 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  35.11 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  32.03 
 
 		 372 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  35.04 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  36.1 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  35.08 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  31.44 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  35.01 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  31.17 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  35.31 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  35.04 
 
 		 358 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  35.9 
 
 		 357 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  35.04 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  34.22 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.91 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  33.07 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  31.98 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  32.71 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  36.06 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  34.42 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  33.16 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.29 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  31.65 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  31.03 
 
 		 361 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  31.85 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.03 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  35.03 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  33.25 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  32.7 
 
 		 358 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1349  alanine racemase  35.28 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  33.78 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  34.47 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>