More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5657 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  100 
 
 		 358 aa  722    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  91.06 
 
 		 358 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  78.93 
 
 		 358 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  53.09 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  52.81 
 
 		 357 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  53.09 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  52.23 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  54.57 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  51.12 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  47.91 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  48.47 
 
 		 361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  48.89 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  49.72 
 
 		 365 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  47.62 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  52.08 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  52.91 
 
 		 361 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  48.75 
 
 		 364 aa  318  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  50.28 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  50.28 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  52.14 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  50.98 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  50.98 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  48.02 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  45.94 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  49.43 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  46.33 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  51.68 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  47.43 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  48.04 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  48.02 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  48.02 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  45.96 
 
 		 359 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  46.5 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  44.77 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  46.37 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  47.89 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  47.88 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  48.59 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  47.59 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  45.68 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  46.37 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  45.81 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  48.59 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  45.68 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  48.59 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  50 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  47.31 
 
 		 373 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  47.31 
 
 		 373 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  47.77 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  47.18 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  47.59 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  47.62 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  47.03 
 
 		 373 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  47.21 
 
 		 356 aa  298  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  47.74 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  44.81 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  42.13 
 
 		 357 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  42.7 
 
 		 357 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  49.58 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  47.71 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  47.47 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  47.51 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  48.44 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  48.44 
 
 		 373 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  47.61 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  46.91 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  48.74 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  47.19 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  48.03 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  46.91 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  46.91 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  46.91 
 
 		 356 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  47.18 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  47.99 
 
 		 358 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  48.2 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  46.91 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  45.71 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  48.31 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  45.71 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  48.46 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  45.53 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  47.7 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  45.2 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  47.04 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  47.88 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  47.7 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  47.88 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  47.88 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>