More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0775 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  98.04 
 
 		 357 aa  728    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  739    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  47.58 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  45.56 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  45.87 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  44.6 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  45.22 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  45.87 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  43.65 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  43.55 
 
 		 358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  45.3 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  44.41 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  46.15 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  45.56 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  45.33 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  42.98 
 
 		 358 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  44.32 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  44.38 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  43.8 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  43.52 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  43.52 
 
 		 359 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  45.09 
 
 		 375 aa  298  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  42.7 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  43.49 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  42.02 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  45.4 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  43.21 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  44.67 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  43.52 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  43.35 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  42.58 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  44.72 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  42.65 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  42.24 
 
 		 358 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  43.1 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  41.21 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  43.02 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  41.95 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  282  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  41.38 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  41.38 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  43.18 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  44.03 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  42.82 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  41.09 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  40.52 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  40.23 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  42.7 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  39.22 
 
 		 378 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  40.52 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  41.97 
 
 		 357 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  42.34 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2818  alanine racemase  43.21 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  40.8 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2441  alanine racemase  43.21 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  41.46 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  42.33 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  39.11 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  37.39 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0958  alanine racemase  41.32 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  38.92 
 
 		 375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  38.42 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  38.59 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  40.33 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  38.59 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1460  alanine racemase  40.38 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  39.55 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  39.84 
 
 		 364 aa  255  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  40 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  40 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  40 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  39.72 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  40.62 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  39.72 
 
 		 356 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  39.83 
 
 		 374 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  39.83 
 
 		 374 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  39.28 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  39.72 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  39.72 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  39.55 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  40.67 
 
 		 373 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>