More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1986 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  100 
 
 		 370 aa  748    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  57.26 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  56.46 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  55.46 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  54.2 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  54.9 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  55.22 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1244  alanine racemase  53.85 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  54.67 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1310  alanine racemase  53.85 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  53.44 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  55.46 
 
 		 363 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  55.71 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  55.71 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  52.78 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  53.78 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  53.78 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  53.78 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  53.22 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  53.78 
 
 		 356 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  55.15 
 
 		 373 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  52.5 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  55.15 
 
 		 373 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  52.5 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  53.52 
 
 		 357 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  52.5 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  53.5 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  55.15 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  52.5 
 
 		 356 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  54.34 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  53.2 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  53.2 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  54.34 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  53.2 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  54.1 
 
 		 374 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  55.25 
 
 		 357 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  52.94 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  55.43 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  52.92 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  52.92 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  52.92 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  52.92 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  55.43 
 
 		 373 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  52.65 
 
 		 356 aa  352  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0229  alanine racemase  53.57 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0488  alanine racemase  52.14 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  53.97 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  53.97 
 
 		 374 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0253  alanine racemase  54.2 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.501756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0194  alanine racemase  54.25 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  53.7 
 
 		 374 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  52.04 
 
 		 367 aa  345  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0176  alanine racemase  53.97 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  52.73 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  52.53 
 
 		 377 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4337  alanine racemase  52.17 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2745  alanine racemase  49.44 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  51.54 
 
 		 365 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  52.09 
 
 		 358 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  51.81 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  51.09 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  50.97 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2530  alanine racemase region  51.25 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  48.62 
 
 		 357 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  51.54 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  50.28 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  49.86 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  49.86 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  49.86 
 
 		 357 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  50 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  48.34 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  49.58 
 
 		 367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  48.19 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  47.93 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  45.53 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  47.38 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  44.26 
 
 		 356 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  47.84 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  46.77 
 
 		 374 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  41 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  43.85 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  44.41 
 
 		 357 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  40.72 
 
 		 364 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  42.94 
 
 		 361 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  48.75 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  44.69 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  45.7 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  42.31 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  44.29 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  45.4 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  42.47 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  41.55 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  47.08 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>