More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1999 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  100 
 
 		 369 aa  751    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  99.72 
 
 		 362 aa  735    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  73.11 
 
 		 366 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  66.85 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  63.41 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  63.13 
 
 		 357 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  63.13 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  60.5 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  59.94 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  60.06 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  61.5 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  59.56 
 
 		 368 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  58.5 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  59.15 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  58.31 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  56.42 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  52.39 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  52.07 
 
 		 364 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  46.11 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  48.42 
 
 		 359 aa  295  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  45.95 
 
 		 365 aa  295  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  48.46 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  45.79 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  46.52 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  47.34 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  44.57 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  44.69 
 
 		 366 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  45.28 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  45.45 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  45.51 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  45.51 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  45.51 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  45.51 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  45.71 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  45.22 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  44.94 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  45.87 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  45.13 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  44.38 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  42.86 
 
 		 359 aa  279  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  44.32 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  42.82 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  44.93 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  41.98 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  44.6 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  44.04 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  43.48 
 
 		 358 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  44.04 
 
 		 359 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  46.67 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  42.12 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  43.58 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  43.58 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  44 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  41.55 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  46.42 
 
 		 367 aa  272  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  41.55 
 
 		 356 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  43.77 
 
 		 359 aa  272  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3629  alanine racemase  46.85 
 
 		 365 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000800676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  41.26 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  44.06 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  42.49 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  44.06 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  43.68 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  42.57 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  43.77 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  41.83 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  41.67 
 
 		 356 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  44.35 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  44.35 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  41.55 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  44.35 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  41.55 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  41.55 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  45.24 
 
 		 356 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  43.43 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>