More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1930 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  100 
 
 		 367 aa  734    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  52.04 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  43.29 
 
 		 364 aa  303  5.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  43.29 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  45.66 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  43.92 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  46.43 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  43.58 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  43.7 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  44.13 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  42.74 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  43.37 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  43.85 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  43.85 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  42.82 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  43.85 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  43.85 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  41.74 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  45.21 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  46.09 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  43.3 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  46.05 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  43.3 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  43.3 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  41.67 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  42.47 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  48.63 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  41.92 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  42.7 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  42.82 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  42.54 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  44.11 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  46.32 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  44.2 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  41.99 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  40.22 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  44.51 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  44.51 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  45.87 
 
 		 361 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  41.71 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  43.41 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  42.34 
 
 		 362 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  41.71 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  43.96 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  43.6 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  43.43 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  40.05 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  40.33 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1310  alanine racemase  45.01 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  44.35 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  40.33 
 
 		 358 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1244  alanine racemase  43.94 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  45.48 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  42.86 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  45.21 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  44.23 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  42.93 
 
 		 374 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  44.23 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  39.94 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  43.65 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  42.86 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  43.67 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  45.01 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  42.31 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  43.13 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  44.03 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  42.31 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  42.58 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  42.31 
 
 		 356 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  43.21 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  39.39 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  43.01 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  41.9 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  43.21 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  43.68 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  43.68 
 
 		 373 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  42.58 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  43.41 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  42.7 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  41.8 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0194  alanine racemase  44.35 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  41.76 
 
 		 356 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  42.46 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  42.86 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0488  alanine racemase  42.02 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  42.31 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  42.86 
 
 		 374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  42.31 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>