More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4448 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  100 
 
 		 359 aa  741    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  81.06 
 
 		 359 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  80.78 
 
 		 359 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  80.5 
 
 		 359 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  71.15 
 
 		 360 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  71.35 
 
 		 359 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  70.95 
 
 		 359 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  70.67 
 
 		 358 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  70.11 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  71.51 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  71.23 
 
 		 359 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  63.76 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  62.57 
 
 		 375 aa  461  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  62.36 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  61.06 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  58.74 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  59.03 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  59.31 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  59.03 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  58.43 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  58.74 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  59.03 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  58.74 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  58.45 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  59.31 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  58.17 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  56.62 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  58.17 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  57.59 
 
 		 358 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  56.78 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  57.02 
 
 		 358 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  56.16 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  52.81 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  43.18 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  42.9 
 
 		 364 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  47.79 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  47.31 
 
 		 356 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  46.96 
 
 		 357 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  47.79 
 
 		 357 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  47.51 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  46.22 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  47.16 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  46.88 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  49.03 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  45.96 
 
 		 361 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  45.1 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  47.85 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  47.34 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  46.48 
 
 		 356 aa  309  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  46.43 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  47.08 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  46.52 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  43.33 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  44.25 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  45.3 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  45.13 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  47.45 
 
 		 363 aa  291  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  45.45 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  47.44 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  47.28 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  42.94 
 
 		 357 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  42.65 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  46.13 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  46.13 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  42.61 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  43.45 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  43.73 
 
 		 358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  45.85 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  44.01 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  45.33 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  45.74 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  43.97 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  43.97 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  44.25 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  44.13 
 
 		 355 aa  278  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  42.06 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>