More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0958 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0958  alanine racemase  100 
 
 		 368 aa  762    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.75052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1460  alanine racemase  81.2 
 
 		 368 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0782  alanine racemase  53.53 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.804762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  42.82 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  41.32 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  41.05 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  42.78 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  42.82 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  41.73 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  40.78 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  40.56 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  38.95 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  40.92 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  42.65 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  41.21 
 
 		 357 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  37.8 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  37.53 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  38.75 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  37.98 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  37.6 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  38.59 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  37.6 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  37.6 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  38.23 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  37.02 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  37.6 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  37.87 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  38.4 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  38.4 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  39.5 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  38.78 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  39.17 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  37.02 
 
 		 373 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  39.17 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  39.17 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  39.17 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  38.46 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  37.53 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  39.5 
 
 		 370 aa  229  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  36.46 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  36.46 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  37.98 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  38.89 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  38.4 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  37.9 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  37.33 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  38.94 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  35.91 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  38.27 
 
 		 357 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  37.64 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  37.91 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  38.36 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  38.36 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  36.9 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  38.12 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  38.12 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  37.7 
 
 		 356 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  38.12 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  36.12 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  36.16 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  37.77 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  36.89 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  35.69 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  37.43 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  37.99 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  37.33 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  38.03 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  37.53 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  35.64 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  36.41 
 
 		 358 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  35.08 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2818  alanine racemase  36.51 
 
 		 364 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2441  alanine racemase  36.51 
 
 		 364 aa  215  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  36.51 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  34.75 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  37.09 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  36.66 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  34.99 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  37.57 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  38.44 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  35.25 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  35.91 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  36.74 
 
 		 358 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  36.26 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  35.96 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  35.73 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  35.73 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  37.74 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>