More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0923 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  100 
 
 		 381 aa  791    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  78.02 
 
 		 374 aa  623  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  51.36 
 
 		 373 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  51.11 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  51.11 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  50.83 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  49.73 
 
 		 368 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1310  alanine racemase  51.09 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  50.68 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1244  alanine racemase  50.82 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  50.68 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  50.56 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  50.56 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  50.68 
 
 		 356 aa  348  7e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  50.54 
 
 		 375 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  50.69 
 
 		 356 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  50 
 
 		 363 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  50.41 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  50.28 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  49.72 
 
 		 356 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  50.14 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  50.14 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  49.86 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  49.58 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  47.95 
 
 		 373 aa  342  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  49.03 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  49.03 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  49.58 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2745  alanine racemase  49.17 
 
 		 357 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  48.75 
 
 		 356 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  48.22 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  48.22 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  47.67 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  47.95 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  47.25 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  47.95 
 
 		 373 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  47.72 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  48.22 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  47.28 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  46.49 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  47.3 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  46.7 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  46.7 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  46.7 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  47.08 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0229  alanine racemase  47.3 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0176  alanine racemase  47.58 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0194  alanine racemase  47.31 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  48.33 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2530  alanine racemase region  47.09 
 
 		 366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4337  alanine racemase  44.95 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  45.89 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0488  alanine racemase  44.06 
 
 		 374 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0253  alanine racemase  45.36 
 
 		 369 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.501756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  46.41 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  41.67 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  41.39 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  42.78 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  41.78 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  43.73 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  46.94 
 
 		 370 aa  272  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  41.29 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  42.78 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  42.78 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  42.78 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  42.78 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  42.5 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  40.39 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  42.9 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  44.2 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  41.67 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  42.78 
 
 		 357 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  42.34 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  41.94 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  41.21 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  41.94 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  42.22 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  41.94 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  42.94 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  42.66 
 
 		 357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  39.73 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  39.83 
 
 		 358 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  40.38 
 
 		 378 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  41.94 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  42.22 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  40.5 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  39.94 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  42.5 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  43.84 
 
 		 368 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>