More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4504 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  100 
 
 
373 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  92.76 
 
 
373 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  93.57 
 
 
373 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  93.3 
 
 
373 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  92.76 
 
 
373 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  93.3 
 
 
373 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  93.03 
 
 
373 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  81.55 
 
 
374 aa  621  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  81.82 
 
 
374 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  81.55 
 
 
374 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  81.82 
 
 
374 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  62.32 
 
 
356 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  62.04 
 
 
356 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  62.04 
 
 
356 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  63.56 
 
 
375 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  61.76 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  61.76 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  63.17 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  62.89 
 
 
356 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  62.04 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  61.76 
 
 
356 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1310  alanine racemase  62.05 
 
 
374 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  62.61 
 
 
363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  62.5 
 
 
373 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  61.28 
 
 
368 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1244  alanine racemase  61.64 
 
 
374 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  62.32 
 
 
356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  61.47 
 
 
356 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  58.71 
 
 
356 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  58.99 
 
 
356 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  58.99 
 
 
356 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2745  alanine racemase  58.64 
 
 
357 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  59.89 
 
 
365 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  56.82 
 
 
356 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  56.53 
 
 
356 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  56.53 
 
 
356 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  56.82 
 
 
356 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  55.34 
 
 
356 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  56.53 
 
 
356 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0176  alanine racemase  59.5 
 
 
365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  59 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0194  alanine racemase  59.5 
 
 
365 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  57.22 
 
 
367 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0229  alanine racemase  57.89 
 
 
366 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  55.8 
 
 
377 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  55.19 
 
 
367 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0253  alanine racemase  57.61 
 
 
369 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.501756  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0488  alanine racemase  54.57 
 
 
374 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4337  alanine racemase  54.5 
 
 
371 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2530  alanine racemase region  55.37 
 
 
366 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  53.85 
 
 
357 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  49.86 
 
 
374 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  55.01 
 
 
370 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  52.53 
 
 
367 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  47.95 
 
 
381 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  52.26 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  52.69 
 
 
367 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  50.14 
 
 
362 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  50.29 
 
 
361 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  50.42 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  48.73 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  50.42 
 
 
368 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  49.86 
 
 
361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  47.59 
 
 
357 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  48.02 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  47.59 
 
 
358 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  46.2 
 
 
358 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  46.74 
 
 
357 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  46.46 
 
 
357 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  46.61 
 
 
357 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  46.46 
 
 
357 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  47.75 
 
 
364 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  45.25 
 
 
364 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  45.28 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  44.51 
 
 
356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  45.89 
 
 
358 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  45.17 
 
 
358 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  45.61 
 
 
358 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  45.61 
 
 
358 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  45.61 
 
 
358 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  44.92 
 
 
358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  45.33 
 
 
358 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  45.32 
 
 
359 aa  281  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  45.32 
 
 
359 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  45.53 
 
 
366 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  45.32 
 
 
359 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  44.48 
 
 
358 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  44.48 
 
 
358 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  43.63 
 
 
358 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>