More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1300 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  100 
 
 		 387 aa  762    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  56.03 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  57.73 
 
 		 377 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  54.67 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  50.28 
 
 		 385 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  47.73 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  47.73 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  50.54 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  47.79 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  52.59 
 
 		 378 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  46.09 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  41.78 
 
 		 373 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  46.01 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  46.19 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  44.83 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  46.28 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  45.96 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  46.32 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  46.48 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  45.36 
 
 		 408 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  50.14 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  46.99 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  46.72 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  44.97 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  49.86 
 
 		 342 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  46.58 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  46.34 
 
 		 407 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  48.75 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  43.82 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  50.42 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  45.45 
 
 		 409 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  46.83 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  43.32 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  45.25 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  41.58 
 
 		 379 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  42.39 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  48.33 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  44.08 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  43.25 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  46.67 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  43.25 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  45.63 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  46.11 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  45.4 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  48.62 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  43.18 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  41.16 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  43.09 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  42.3 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  42.91 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  40.17 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  38.61 
 
 		 358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.12 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.99 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  31.93 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  37.26 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.51 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.36 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.24 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  31.89 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  36.74 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.14 
 
 		 380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.93 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  36.65 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.65 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0782  alanine racemase  33.42 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.804762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.75 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  35.37 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  35.81 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  36.08 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  36.81 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.06 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  32.55 
 
 		 835 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  37.57 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.48 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  28.92 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  31.34 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  30.73 
 
 		 842 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  33.16 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  34.96 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  34.13 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  30.08 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  34.13 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  31.94 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  38.4 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  34.13 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  29.54 
 
 		 822 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  36.29 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  37.13 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.87 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  29.47 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.78 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  33.43 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3629  alanine racemase  33.33 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000800676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  30.54 
 
 		 834 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  34.89 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  32.35 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  33.87 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  34.99 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  34.23 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>