More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2266 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  45.65 
 
 		 823 aa  704    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  47.03 
 
 		 834 aa  743    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  100 
 
 		 835 aa  1728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1318  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  43.98 
 
 		 822 aa  694    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  47.77 
 
 		 842 aa  777    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3032  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  46.66 
 
 		 817 aa  697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.429122  normal  0.0119577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4988  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  58.43 
 
 		 824 aa  961    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  44.36 
 
 		 368 aa  325  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0034  alanine racemase  38.68 
 
 		 369 aa  279  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  27.89 
 
 		 851 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.73 
 
 		 390 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.46 
 
 		 369 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.7 
 
 		 390 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.51 
 
 		 388 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  33.59 
 
 		 391 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  32.22 
 
 		 380 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.9 
 
 		 389 aa  204  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.43 
 
 		 377 aa  203  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.67 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.28 
 
 		 392 aa  201  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.67 
 
 		 397 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.84 
 
 		 378 aa  197  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.45 
 
 		 395 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.9 
 
 		 391 aa  194  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.9 
 
 		 391 aa  193  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.99 
 
 		 391 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  36.39 
 
 		 380 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  36.39 
 
 		 390 aa  192  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.72 
 
 		 379 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.73 
 
 		 391 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  32.85 
 
 		 408 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.42 
 
 		 403 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  32.73 
 
 		 398 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  35.19 
 
 		 370 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  32.73 
 
 		 391 aa  190  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  31.77 
 
 		 374 aa  190  9e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.73 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.51 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  32.47 
 
 		 391 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  32.47 
 
 		 391 aa  189  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.36 
 
 		 373 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.47 
 
 		 391 aa  188  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.9 
 
 		 373 aa  188  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.56 
 
 		 373 aa  188  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.51 
 
 		 370 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  24.91 
 
 		 811 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  33.95 
 
 		 364 aa  185  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.75 
 
 		 373 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  31.43 
 
 		 373 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  33.16 
 
 		 387 aa  184  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.63 
 
 		 379 aa  184  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  35.48 
 
 		 379 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.1 
 
 		 380 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  35.56 
 
 		 356 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  35.22 
 
 		 379 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.29 
 
 		 386 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  32.45 
 
 		 371 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  33.59 
 
 		 384 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  34.29 
 
 		 386 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.52 
 
 		 403 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.85 
 
 		 379 aa  180  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.45 
 
 		 395 aa  178  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  34.41 
 
 		 358 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.27 
 
 		 403 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.11 
 
 		 384 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  29.4 
 
 		 441 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  34.1 
 
 		 382 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.63 
 
 		 373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  33.16 
 
 		 380 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.38 
 
 		 395 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.18 
 
 		 411 aa  174  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  32.48 
 
 		 390 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  31.47 
 
 		 395 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.38 
 
 		 395 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  32.98 
 
 		 361 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  32.9 
 
 		 395 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  33.77 
 
 		 375 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  25.52 
 
 		 844 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  30.82 
 
 		 421 aa  171  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  31.73 
 
 		 356 aa  171  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  29.71 
 
 		 369 aa  170  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  170  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  34.19 
 
 		 433 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  32.9 
 
 		 358 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  34.28 
 
 		 389 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.16 
 
 		 382 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  33.76 
 
 		 389 aa  168  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  34.57 
 
 		 358 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.05 
 
 		 375 aa  168  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  33.42 
 
 		 371 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  30.99 
 
 		 364 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  31.91 
 
 		 366 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1850  alanine racemase  33.78 
 
 		 367 aa  167  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.801979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  34.22 
 
 		 372 aa  167  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  33.76 
 
 		 389 aa  167  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>