More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3896 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  100 
 
 		 364 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  75.57 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  75.37 
 
 		 342 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  75.37 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  68.32 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  68.6 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  49.45 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  50 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  50.28 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  49.31 
 
 		 395 aa  309  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  49.03 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  52.23 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  54.02 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  50.14 
 
 		 409 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  49.86 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  49.86 
 
 		 423 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  48.16 
 
 		 408 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  46.99 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  47.22 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  47.41 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  45.6 
 
 		 387 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  50.42 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  51.24 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  49.58 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  46.11 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  46.25 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  45.58 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  45.58 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  46.81 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  50.69 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  49.02 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  45.19 
 
 		 408 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  44.81 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  46.87 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  43.21 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  44.14 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  40.4 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  43.42 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  45.35 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  45.33 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  45.33 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  45.13 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  46.67 
 
 		 378 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  44.67 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  47.31 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  45.2 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  41.13 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  43.3 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  45.61 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  43.63 
 
 		 348 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  41.94 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  37.5 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  36.24 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.39 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  36.94 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  36.39 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1930  alanine racemase  36.39 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  32.24 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  38.1 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  32.79 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.16 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.37 
 
 		 834 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.13 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.24 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  35.64 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  33.8 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  33.05 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.25 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.24 
 
 		 380 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  32.49 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.8 
 
 		 411 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  36.13 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  36.36 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  31.36 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0782  alanine racemase  32.08 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.804762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.96 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  34.88 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  33.33 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  31.22 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  28.49 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.11 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.11 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  34.84 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  34.84 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4988  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.15 
 
 		 824 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  34.56 
 
 		 356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  30.47 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  30.87 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  32.13 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  30.87 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.88 
 
 		 395 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  29.78 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  36.16 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  33.89 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  33.89 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>