More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0672 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  100 
 
 		 383 aa  761    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  56.71 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  56.03 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  50.83 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  49.31 
 
 		 380 aa  352  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  48.39 
 
 		 396 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  51.93 
 
 		 388 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  48.39 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  49.58 
 
 		 374 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  53.46 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  51.67 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  42.09 
 
 		 373 aa  305  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  44.88 
 
 		 409 aa  301  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  45.76 
 
 		 408 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  46.24 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  45.68 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  44.1 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  43.43 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  48.99 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  46.65 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  44.89 
 
 		 408 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  48.99 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  46.67 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  48.75 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  45.03 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  46.96 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  44.38 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  42.08 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  49.72 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  49.03 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  46.26 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  43.62 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  43.53 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  46.28 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  40.27 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  42.49 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  45.38 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  45.38 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  47.68 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  45.56 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  40.85 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  43.9 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  44.32 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  43.53 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  43.96 
 
 		 345 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  44.08 
 
 		 423 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  41.67 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  40.51 
 
 		 356 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  45.65 
 
 		 294 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.46 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  39.94 
 
 		 348 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  36.29 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.98 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  37.71 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.75 
 
 		 378 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  35.89 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.92 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.86 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.05 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.89 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.9 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.45 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  37.02 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.6 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.53 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.78 
 
 		 384 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  37.29 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.8 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.43 
 
 		 376 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  34.9 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  33.42 
 
 		 380 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  34.86 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  34.86 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  34.86 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.77 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  30.87 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  35.47 
 
 		 378 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.55 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  32.44 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  32.44 
 
 		 382 aa  162  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  32.87 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.83 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  30.29 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  30.53 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.28 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  34.63 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  30.03 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  34.63 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  34.05 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  31.82 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.43 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  35.16 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  31.78 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  31.73 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  31.42 
 
 		 359 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.09 
 
 		 395 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  29.49 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  29.6 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  35.14 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>