More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  100 
 
 		 378 aa  751    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  70.84 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  55.41 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  55.14 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  54.03 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  54.03 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  54.03 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  53.24 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  53.62 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  53.89 
 
 		 402 aa  341  9e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  53.12 
 
 		 417 aa  342  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  53.7 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  54.13 
 
 		 380 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  53.58 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  53.85 
 
 		 383 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  51.34 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  53.16 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  52.42 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  47.89 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  54.69 
 
 		 378 aa  318  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  53.77 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  53.59 
 
 		 375 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  49.48 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  50.27 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  50.67 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  52.27 
 
 		 380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  51.6 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  48.25 
 
 		 366 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  52.3 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  50.94 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  49.74 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  48.68 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  49.07 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  46.78 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  46.79 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  42.01 
 
 		 459 aa  268  8.999999999999999e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  49.6 
 
 		 381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  48.75 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  46.3 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  42.97 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  46.03 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.77 
 
 		 389 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  42.97 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.42 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  42.19 
 
 		 371 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.15 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  37.98 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.42 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  39.07 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  44.23 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.15 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.15 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  38.25 
 
 		 390 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  38.15 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  37.98 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  37.87 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  38.36 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  38.11 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.15 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  42.74 
 
 		 373 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.03 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  41.67 
 
 		 373 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  41.14 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.61 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.52 
 
 		 373 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.34 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  40.21 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  46.98 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  40.84 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  38.17 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.4 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  37.4 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40.78 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  41.22 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.13 
 
 		 403 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  36.34 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  41.19 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  36.34 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  39.33 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  39.41 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  38.27 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.79 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  32.98 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  36.66 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  41.22 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  37.43 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  37.53 
 
 		 379 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.24 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  34.22 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  35.98 
 
 		 364 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  35.48 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  33.42 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.22 
 
 		 395 aa  212  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  34.14 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  45.78 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  36.26 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  34.88 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  34.88 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  39.4 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.44 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>