More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0865 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  99.75 
 
 
396 aa  796    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  83.64 
 
 
380 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  100 
 
 
396 aa  799    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  53.51 
 
 
374 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  48.8 
 
 
373 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  53.1 
 
 
377 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  51.48 
 
 
377 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  50.27 
 
 
388 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  48.39 
 
 
383 aa  345  8e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  52.27 
 
 
378 aa  338  9e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  49.19 
 
 
377 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  47.73 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  43.2 
 
 
385 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  43.72 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  42.86 
 
 
374 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  43.13 
 
 
370 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.05 
 
 
366 aa  266  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  42.86 
 
 
364 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  43.4 
 
 
357 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  41.16 
 
 
409 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.41 
 
 
408 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  45.04 
 
 
364 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  42.74 
 
 
342 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  40.11 
 
 
413 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  44.59 
 
 
357 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  38.73 
 
 
394 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  42.46 
 
 
342 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  40 
 
 
398 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  48.61 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  38.46 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  41.87 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  40.64 
 
 
360 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  39.84 
 
 
407 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  38.61 
 
 
395 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  43.39 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  40.1 
 
 
389 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  39.84 
 
 
409 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  39.85 
 
 
388 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  37.89 
 
 
379 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.13 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  37.2 
 
 
387 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  41.35 
 
 
349 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  39.21 
 
 
423 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  40.43 
 
 
345 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  39.68 
 
 
349 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  39.14 
 
 
349 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  38.93 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  37.66 
 
 
373 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  40.65 
 
 
348 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.55 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  36.93 
 
 
356 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.93 
 
 
370 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.68 
 
 
376 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.7 
 
 
380 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.64 
 
 
403 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.5 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.46 
 
 
403 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.33 
 
 
399 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  34.14 
 
 
375 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.07 
 
 
395 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.66 
 
 
411 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  37.23 
 
 
348 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.47 
 
 
403 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.94 
 
 
379 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  37.07 
 
 
358 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.38 
 
 
398 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.31 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  36.34 
 
 
365 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.92 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.51 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.24 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.55 
 
 
379 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.94 
 
 
384 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  33.86 
 
 
433 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  31.92 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.92 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.67 
 
 
391 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.68 
 
 
395 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.53 
 
 
358 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.27 
 
 
368 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.67 
 
 
391 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  30.08 
 
 
391 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.98 
 
 
369 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.19 
 
 
391 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  35.42 
 
 
357 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.19 
 
 
391 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.14 
 
 
395 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  35.75 
 
 
357 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.96 
 
 
360 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  35.42 
 
 
357 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  32.64 
 
 
359 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  34.92 
 
 
364 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.14 
 
 
395 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  34.13 
 
 
374 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  30.42 
 
 
399 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.09 
 
 
391 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  34.42 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  34.42 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  32.98 
 
 
374 aa  166  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  30.58 
 
 
391 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>