More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3850 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  100 
 
 		 384 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  76.27 
 
 		 379 aa  614  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  73.33 
 
 		 382 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  71.93 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  70.9 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  70.37 
 
 		 379 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  67.73 
 
 		 380 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  53.78 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  44.5 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  42.67 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  46.79 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  45.21 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  44.5 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  43.62 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  42.86 
 
 		 411 aa  296  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  42.05 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  39.25 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.61 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  43.24 
 
 		 391 aa  288  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.34 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  38.5 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.07 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  44.01 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  40.16 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.34 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.07 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.07 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  38.34 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  42.36 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  41.49 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  38.61 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  38.34 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  43.89 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  38.34 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  42.25 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.25 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  38.04 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40.67 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  41.07 
 
 		 851 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  39.63 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  40.27 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.4 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  40.27 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  39.2 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.32 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  37.77 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  38.87 
 
 		 386 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.05 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  38.87 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.5 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  39.3 
 
 		 811 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  41.82 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  40.8 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.04 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.95 
 
 		 395 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  40.05 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.04 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.7 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  36.71 
 
 		 406 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  37.17 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.17 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  41.55 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  36.1 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.31 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  37.34 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  37.5 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  36.53 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  37.83 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.42 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  34.69 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  39.35 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  36.14 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  36.76 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  34.78 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.39 
 
 		 834 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  36.07 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  37.47 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  37.99 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.72 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  35.7 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  35.25 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  37.8 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  37.73 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  38.44 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  38.4 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  36.94 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  34.32 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  34.03 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  37.53 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  39.89 
 
 		 849 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.3 
 
 		 384 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  39.47 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  37.27 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>