More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1046 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  94.44 
 
 		 389 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  100 
 
 		 388 aa  783    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  69.43 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  63.88 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  54.32 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  45.97 
 
 		 408 aa  302  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  44.78 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  45.36 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  45.36 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  44.81 
 
 		 374 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  44.11 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  44.11 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  45.8 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  42.49 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  41.34 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  44.2 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  43.01 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  44.57 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  41.89 
 
 		 385 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  40.49 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  43.65 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  42.74 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  40.1 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  39.64 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  40.22 
 
 		 374 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  46.59 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  43.41 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  43.41 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  39.85 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  43.87 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  42.19 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  43.28 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  41.1 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  40.69 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  42.7 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  45.41 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  43.49 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  42.13 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  39.24 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  41.14 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  40.97 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  40.97 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  39.51 
 
 		 345 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  39.47 
 
 		 373 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  42.05 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  40.38 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  40.93 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  39.64 
 
 		 356 aa  199  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  38.36 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  41.2 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  38.86 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  31.61 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.6 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  36.56 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  32.6 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.36 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.39 
 
 		 358 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  31.55 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.06 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  30.95 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  32.08 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  32.62 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1349  alanine racemase  36.59 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  31.88 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  31.52 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  35.26 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  34.34 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  33.88 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  33.78 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  33.6 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  35.04 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  30.98 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  30.68 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  34.34 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  34.55 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  34.53 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  30.49 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  31.56 
 
 		 358 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  32.48 
 
 		 835 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  31.23 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  31.23 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  31.23 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.97 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  31.23 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  33.78 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  33.24 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  32.97 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  30.27 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  28.72 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  34.35 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  32.52 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  33.8 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  33.87 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  34.71 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>