More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4830 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  88.33 
 
 		 377 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  100 
 
 		 377 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  57.14 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  71.74 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  55.28 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  53.1 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  53.1 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  53.19 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  53.57 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  44.48 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  48.6 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  46.24 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  46.01 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  43.6 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  43.68 
 
 		 408 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  44.23 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.32 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  42.62 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  41.92 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  43.17 
 
 		 385 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.58 
 
 		 408 aa  252  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  42.62 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  40.27 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  41.37 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  41.05 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  43.89 
 
 		 357 aa  239  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  39.84 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  43.06 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  43.06 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  43.32 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  41.1 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  44.08 
 
 		 349 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  39.89 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  42.66 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  41.48 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  40.77 
 
 		 407 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  40.43 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  41.57 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  39.67 
 
 		 413 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  42.66 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  40 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.62 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  40.63 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  40.63 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  38.5 
 
 		 409 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  37.12 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  38.66 
 
 		 356 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  37.4 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  38.67 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  35.42 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  39.44 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  35.2 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.5 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.89 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.6 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  34.92 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.51 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.85 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  37.85 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  34.77 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.79 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  36.24 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.15 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  34.96 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.35 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  34.55 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  34.55 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  34.77 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02410  alanine racemase  32.42 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269593  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  36.59 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  34.27 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.6 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  36.39 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.24 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  36.49 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.96 
 
 		 384 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  35.85 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  35.8 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  32.87 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  33.15 
 
 		 357 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  33.7 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  34.78 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  34.25 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.33 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  32.69 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  35.82 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  30.33 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.46 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  33.98 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  35.93 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  35.73 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  36.59 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  33.42 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  33.24 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  34.59 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  35.43 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.25 
 
 		 395 aa  152  7e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  30.52 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  30.54 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  31.88 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>