More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1227 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  100 
 
 		 348 aa  693    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  61.81 
 
 		 348 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  55.75 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  39.3 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  43.38 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  41.26 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  42.36 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  39.88 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  39.66 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  39.78 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  39.59 
 
 		 342 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  43.39 
 
 		 342 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  36.44 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  41.71 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  40.39 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  43.77 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  40.73 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  43.71 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  39.37 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  39.15 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  38.86 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  40.29 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  41.45 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  41.62 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  40.33 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  37.43 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  40.79 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  41.33 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  40.75 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  39.5 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  40 
 
 		 408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  39.4 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  37.47 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  39.33 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  36.76 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  37.4 
 
 		 409 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  37.71 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  37.46 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  37.75 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  37.23 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  37.23 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  37.29 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  37.14 
 
 		 423 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  38.86 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  38.66 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  38.7 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  37.2 
 
 		 409 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  37.85 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  39.44 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  38.59 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  33.7 
 
 		 373 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  40.58 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.34 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  35.48 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.15 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  32.78 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  28.32 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  32.19 
 
 		 359 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  31.27 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  30.91 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  30.91 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  32.28 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  34.92 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  27.91 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  31.82 
 
 		 358 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  32.86 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  36.59 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.62 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  36.14 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  31.86 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  26.48 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.66 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  32.69 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  32.31 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.04 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  30.3 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  35.37 
 
 		 357 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  31.61 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  35.42 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  35.69 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  32.03 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  35.16 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.33 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  30.16 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  32.48 
 
 		 359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  33.52 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  30.51 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  31.07 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  35.24 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  33.33 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  34.84 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.16 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  33.8 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  35.46 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>