More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1885 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  100 
 
 
397 aa  781    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  36.86 
 
 
390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.53 
 
 
389 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.16 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  42.48 
 
 
379 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.58 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  44.17 
 
 
811 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  35.46 
 
 
386 aa  243  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  37.07 
 
 
379 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  41.76 
 
 
851 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  41.41 
 
 
380 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.73 
 
 
386 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.81 
 
 
395 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  40.37 
 
 
380 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.39 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  42.51 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  36.41 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.54 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.95 
 
 
391 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.18 
 
 
390 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  42.9 
 
 
378 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.63 
 
 
398 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  34.48 
 
 
391 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.22 
 
 
391 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.95 
 
 
391 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.22 
 
 
391 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.68 
 
 
391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.68 
 
 
391 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  41.34 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.95 
 
 
391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.95 
 
 
391 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.95 
 
 
391 aa  226  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  40.1 
 
 
387 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  38.5 
 
 
370 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  39.84 
 
 
433 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  38.02 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.04 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.86 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  39.62 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  39.62 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  38.81 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  38.46 
 
 
377 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.9 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  38.11 
 
 
403 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.39 
 
 
390 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.3 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  39.47 
 
 
384 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  33.16 
 
 
399 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  36.6 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  35.71 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.8 
 
 
371 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  40.42 
 
 
408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.64 
 
 
373 aa  216  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  38.03 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  34.13 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  40.21 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  33.78 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  35.45 
 
 
373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  37.6 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.6 
 
 
408 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.87 
 
 
380 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  40.48 
 
 
379 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  40.48 
 
 
379 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.97 
 
 
399 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.11 
 
 
376 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.95 
 
 
395 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.36 
 
 
380 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.69 
 
 
395 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  37.4 
 
 
381 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  37.73 
 
 
389 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.75 
 
 
395 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  40.32 
 
 
375 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  36.67 
 
 
835 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  37.73 
 
 
389 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  38.34 
 
 
402 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  40.64 
 
 
405 aa  203  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  42.36 
 
 
381 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.18 
 
 
364 aa  202  7e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.03 
 
 
384 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.19 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  33.78 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  36.81 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.28 
 
 
399 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.18 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  34.84 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.47 
 
 
844 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  35.68 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.68 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  40.05 
 
 
371 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  38.83 
 
 
398 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.94 
 
 
834 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1097  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.81 
 
 
823 aa  199  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.430466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  43.77 
 
 
365 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.36 
 
 
842 aa  199  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>