More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0425 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  100 
 
 		 374 aa  760    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2031  alanine racemase  51.19 
 
 		 376 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1349  alanine racemase  53.08 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.1 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.57 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.04 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.33 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  35.05 
 
 		 373 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.6 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.14 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  38.58 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.25 
 
 		 403 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.37 
 
 		 851 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.33 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.17 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  33.88 
 
 		 395 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.17 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  36.12 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.78 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.1 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.67 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  35.42 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.14 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  35.04 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  31.18 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  31.56 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  35.55 
 
 		 379 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.98 
 
 		 373 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  33.43 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.71 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  35.6 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.71 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  35.48 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  35.79 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.28 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  31.35 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  35.79 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  36.51 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  37.13 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  34.63 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.17 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  34.32 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.33 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  36.59 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  34.55 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  36.11 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  34.13 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.2 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.15 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  34.13 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.91 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  34.88 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  37.37 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  34.58 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  36.9 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  31.85 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.24 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.27 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  35.95 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  38.41 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  30.73 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  30.73 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  31.52 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  29.64 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  31.85 
 
 		 386 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  34.6 
 
 		 366 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  37.01 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  34.56 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  35 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  35 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  35 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  34.72 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  34.07 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  33.42 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  35.07 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  35.92 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  28.99 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.25 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  32.55 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  34.23 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  32.33 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  36.24 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  32.34 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  29.89 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  34.72 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  30.73 
 
 		 391 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  34.72 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  34.25 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  34.69 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  34.72 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  36.08 
 
 		 397 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  35.69 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  34.08 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  37.37 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  29.33 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  33.51 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>