More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1025 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  100 
 
 		 364 aa  758    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  62.26 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  44.89 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  41.46 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  42.86 
 
 		 392 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  43.24 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  44.77 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  42.59 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  42.59 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  42.44 
 
 		 373 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  44.44 
 
 		 391 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  44.15 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  44.15 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  44.44 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  43.4 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  43.4 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  41.91 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  41.07 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  43.86 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  40.59 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  44.12 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  41.02 
 
 		 377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  41.67 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  40.59 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.32 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  41.4 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  40.86 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.16 
 
 		 379 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.98 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  41.35 
 
 		 389 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  40.86 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  42.54 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  40.54 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  43.86 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  41.44 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  38.2 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  40.59 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  40.81 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.8 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.05 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.27 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  38.3 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.65 
 
 		 851 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.69 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  40.17 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  40.22 
 
 		 367 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  41.79 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  40.16 
 
 		 376 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  41.79 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  41.5 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  40 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40.92 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  41.21 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.16 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.82 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.16 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  38.5 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  38.38 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.04 
 
 		 395 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  36.78 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.48 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  38.69 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  37.27 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  35.25 
 
 		 390 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.86 
 
 		 403 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  37.97 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  38.96 
 
 		 811 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36.34 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  40.11 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  37.81 
 
 		 365 aa  222  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  35.87 
 
 		 378 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  40.73 
 
 		 324 aa  222  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.95 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  36.6 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.29 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36.24 
 
 		 403 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  37.79 
 
 		 395 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  38.62 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  37.2 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  37.2 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  37.2 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.15 
 
 		 395 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  36.9 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  39.62 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  35.43 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  41.18 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  37.5 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.34 
 
 		 375 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.88 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  39.27 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  34.96 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  36.99 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.88 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  33.97 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  33.97 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>