More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0057 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  100 
 
 		 390 aa  791    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  55.47 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  52.66 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  47.63 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  44.65 
 
 		 373 aa  364  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  45.19 
 
 		 373 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  44.92 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  46.11 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  48.13 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  45.36 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  44.95 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  42.78 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  49.21 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  43.95 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  42.51 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  42.25 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  46.19 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  48.57 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  43.27 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  41.04 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  41.78 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  41.78 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  41.41 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  41.78 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  47.78 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  41.25 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  40.99 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  40.99 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  41.51 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  41.02 
 
 		 398 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  41.21 
 
 		 370 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  41.25 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  42.3 
 
 		 408 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  40.99 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  40.99 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  41.38 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  42.33 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.78 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.62 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  46.65 
 
 		 811 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  43.09 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  43.24 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  44.05 
 
 		 851 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.98 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  42.33 
 
 		 375 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  41.71 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  40.21 
 
 		 395 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  41.64 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  41.64 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  42.67 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  41.05 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  40.58 
 
 		 441 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  39.01 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  39.38 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  39.53 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  39.33 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  39.07 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  40.91 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  38.68 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  45.16 
 
 		 849 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  41.64 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  38.66 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  39.1 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  40.72 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  41.36 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.42 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  41.36 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  40.76 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.8 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  38.08 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.05 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  38.6 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  38.08 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  41.22 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  38.93 
 
 		 834 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  39.48 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  43.77 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  37.47 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  41.42 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  41.91 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  34.04 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  41.99 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  41.9 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  40.79 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  41.05 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  37.76 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  43.62 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  37.76 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  37.57 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.5 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  43.62 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  43.62 
 
 		 844 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  38.67 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  38.26 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>