More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6556 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  100 
 
 		 388 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  70.95 
 
 		 378 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  54.18 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  54.18 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  54.18 
 
 		 383 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  54.37 
 
 		 372 aa  359  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  54.37 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  52.03 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  52.83 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  54.23 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  51.96 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  52.22 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  51.63 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  54.22 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  52.33 
 
 		 381 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  52.17 
 
 		 437 aa  326  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  54.64 
 
 		 374 aa  325  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  51.37 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  53.37 
 
 		 380 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  53.06 
 
 		 375 aa  315  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  51.57 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  52.46 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  51.76 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  49.34 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  51.05 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  53.5 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  51.33 
 
 		 410 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  49.47 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  46.15 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  52.62 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  50 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  46.3 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  48.11 
 
 		 415 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  46.88 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  45.86 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  43.92 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  41.83 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  39.23 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  47.11 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  43.78 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.87 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  43.18 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.11 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.21 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  48.1 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.49 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  40.69 
 
 		 395 aa  243  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  40.05 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.93 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  41.97 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  40.98 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.07 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  44.15 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  48.79 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.1 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  40.78 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.19 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.64 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  39.43 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.87 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.21 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  40.22 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.23 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.38 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  41.13 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  40.94 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.34 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  42.27 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  35.44 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  39.55 
 
 		 851 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  35.69 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  41.11 
 
 		 395 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.24 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  38.62 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  35.16 
 
 		 373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  41.67 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.97 
 
 		 392 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  35.97 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  41.11 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  36.24 
 
 		 408 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  41.19 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  32.61 
 
 		 369 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  36.39 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.79 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  38.75 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.16 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  42.9 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  38.52 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.33 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.74 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.42 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.6 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  40.56 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.41 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>