More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0923 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  83.9 
 
 		 380 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  100 
 
 		 396 aa  799    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  99.75 
 
 		 396 aa  796    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  53.51 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  48.8 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  53.1 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  51.48 
 
 		 377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  50.27 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  48.39 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  52.53 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  49.19 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  47.73 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  43.2 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  43.97 
 
 		 408 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  42.86 
 
 		 374 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  43.13 
 
 		 370 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  42.05 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  42.86 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  43.4 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  41.16 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  41.41 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  42.74 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  45.04 
 
 		 364 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  40.11 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  44.59 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  38.73 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  42.46 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  38.72 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  40 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  48.61 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  40.91 
 
 		 360 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  39.84 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  41.87 
 
 		 363 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  43.65 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  38.61 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  40.36 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  40.1 
 
 		 388 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  39.84 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  41.13 
 
 		 342 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  37.89 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  37.2 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  41.35 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  39.21 
 
 		 423 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  40.43 
 
 		 345 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  39.84 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  39.3 
 
 		 349 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  38.93 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  37.66 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  40.65 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.94 
 
 		 375 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  36.93 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  35.2 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  37.77 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  34.68 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  35.7 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.64 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.46 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  33.33 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  32.33 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  34.32 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.66 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  37.23 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.47 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  37.07 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.38 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  36.61 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.94 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  36.78 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.92 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  36.51 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.31 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.81 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  33.86 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.92 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  33.24 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.94 
 
 		 384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  31.92 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.68 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  36.03 
 
 		 357 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.53 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  35.69 
 
 		 357 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.67 
 
 		 391 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.67 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  34.23 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  30.08 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  35.69 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  32.9 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.14 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  35.19 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  32.27 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.19 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.19 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.14 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  30.42 
 
 		 399 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.09 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  34.42 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  34.42 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  35.01 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0425  alanine racemase  34.13 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.718274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  30.58 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>