More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4822 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  100 
 
 		 377 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  56.71 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  57.73 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  51.2 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  54.32 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  49.19 
 
 		 396 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  49.19 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  48.75 
 
 		 380 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  51.37 
 
 		 385 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  54.6 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  42.94 
 
 		 373 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  48.6 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  48.6 
 
 		 377 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  49.58 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  47.04 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  48.48 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  46.58 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  46.77 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  47.79 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  46.28 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  44.88 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  45.75 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  43.43 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  46.41 
 
 		 407 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  50.28 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  49.3 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  44.39 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  51.24 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  49.16 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  48.74 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  44.94 
 
 		 366 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  47.51 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  42.89 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  45.3 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  48.14 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  48.16 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  48.32 
 
 		 370 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  45.8 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  46.11 
 
 		 342 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  46.17 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  46.17 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  49.73 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  44.75 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  46.7 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  49.65 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  44.51 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  45.48 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  42.47 
 
 		 373 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  42.86 
 
 		 348 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  43.5 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  43.98 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  36.98 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.15 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  37.7 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.72 
 
 		 395 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  39.39 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.72 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  39.11 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  37.53 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  38.83 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  37 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  37 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  37 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  40.67 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  39.17 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  34.73 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  38.51 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  35.51 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  37.47 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  38.77 
 
 		 368 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  29.09 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.98 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  34.24 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  33.42 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  36.56 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  37.25 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  36.01 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  34.94 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  34.32 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  34.94 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  34.93 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  34.93 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  34.08 
 
 		 358 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  35.92 
 
 		 358 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2266  alanine racemase  34.13 
 
 		 835 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.71922  normal  0.103081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  33.06 
 
 		 361 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  33.69 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  31.66 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.63 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  36.8 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.07 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.98 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  34.65 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  39.11 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  33.99 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  33.99 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  37.47 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  29.23 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  33.81 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.07 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>