More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2871 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2871  alanine racemase  100 
 
 		 357 aa  707    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4410  alanine racemase  52.3 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3896  alanine racemase  54.02 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655111  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4305  alanine racemase  51.61 
 
 		 342 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3937  alanine racemase  51.61 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0409  alanine racemase  52.69 
 
 		 374 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1502  alanine racemase  49.31 
 
 		 388 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196094  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4822  alanine racemase  50.28 
 
 		 377 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55771  normal  0.0192728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4632  alanine racemase  51 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0672  alanine racemase  49.72 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15843  hitchhiker  0.005206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0396  alanine racemase  47.58 
 
 		 385 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  42.21 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2014  alanine racemase region  47.27 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109646  normal  0.427468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2290  alanine racemase  47.27 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.669413  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6080  alanine racemase  44.66 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0914  alanine racemase  45.81 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.452475  decreased coverage  0.000000188246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2595  alanine racemase  50.43 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2289  alanine racemase  47.81 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3482  alanine racemase  46.63 
 
 		 408 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0923  alanine racemase  44.59 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489624  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0865  alanine racemase  44.59 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0599236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3495  alanine racemase  45.38 
 
 		 413 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1445  alanine racemase  45.07 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3807  putative alanine racemase (alr)  45.14 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0807  alanine racemase  46.88 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1208  alanine racemase  43.22 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1192  alanine racemase  43.21 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.216373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1300  alanine racemase  48.48 
 
 		 387 aa  255  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0986  alanine racemase  45.45 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0601461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1508  alanine racemase  43.49 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2992  alanine racemase  44.96 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0730  alanine racemase  43.49 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2403  alanine racemase  44.82 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.438825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2457  alanine racemase  46.09 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4776  alanine racemase  42.61 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.102133 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4830  alanine racemase  42.09 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2506  alanine racemase  44.48 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2308  alanine racemase  41.37 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1046  alanine racemase  42.11 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3109  alanine racemase  42.47 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.874814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1739  alanine racemase  44.48 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813541  normal  0.651702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0013  alanine racemase  42.74 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2460  alanine racemase  43.77 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.317567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1123  alanine racemase  43.77 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2378  alanine racemase  43.94 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1068  alanine racemase  43.21 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3689  alanine racemase  46.07 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.376484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1779  alanine racemase  41.24 
 
 		 345 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155065  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1952  alanine racemase  42.12 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1227  alanine racemase  38.79 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  36.67 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  36.67 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.05 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.26 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  35.38 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  35.71 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8142  alanine racemase  42.7 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  36.34 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  35.56 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  33.98 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  33.62 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  36.06 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  33.97 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  33.97 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  36.15 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.52 
 
 		 370 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  35.96 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  33.51 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.15 
 
 		 395 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  32.46 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4025  alanine racemase  32.88 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.61 
 
 		 403 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  30.16 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2381  alanine racemase  33.15 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  33.51 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  36.34 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.97 
 
 		 395 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  32.46 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  31.17 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  32.88 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.95 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  33.84 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  36.86 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  34.93 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  32.98 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  34.93 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.43 
 
 		 834 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.17 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  31.44 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  37.47 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  31.41 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  34.17 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  35.33 
 
 		 366 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  31.38 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.79 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  33.14 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  32.93 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  35.53 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  28.88 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  31.25 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>