More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1008 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  100 
 
 		 343 aa  697    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  44.14 
 
 		 324 aa  259  7e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  35.28 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  35.28 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  31.62 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  31.62 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.35 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.7 
 
 		 392 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  33.33 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  32.28 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.7 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.8 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  31.94 
 
 		 395 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.06 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  35.23 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  30.03 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  29.84 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  31.09 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.18 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  29.53 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1093  alanine racemase  32.04 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0327033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  29.49 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  33.6 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  31.7 
 
 		 398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  31.32 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.69 
 
 		 391 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  31.97 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  30.36 
 
 		 387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  29.65 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.78 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  32.58 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  30.29 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.48 
 
 		 391 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  32.74 
 
 		 382 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  30 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  28.49 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.48 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.6 
 
 		 399 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  32.59 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.41 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  30.93 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  31.12 
 
 		 391 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  31.89 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0804  hypothetical protein  31.37 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.97 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.79 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  32.22 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  32.39 
 
 		 376 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  29.71 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  30.64 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  30.64 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  30.27 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  32.1 
 
 		 408 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0775  hypothetical protein  31.09 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  29.7 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.68 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  32.87 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  32.05 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  31.5 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  33.14 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  32.27 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.4 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  32.69 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.75 
 
 		 399 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.23 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  30.03 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  29.43 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  32.49 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  31.12 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  30.75 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  28.88 
 
 		 402 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  31.31 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0159  alanine racemase  33.04 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  29.09 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  31.36 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  31.84 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.79 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  31.52 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  29.43 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  30.75 
 
 		 379 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2882  alanine racemase  30.33 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  33.6 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  28.87 
 
 		 361 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  31.52 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  30.03 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  31.64 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  29.86 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  32.79 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  30.99 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  30.99 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  31.09 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  27.78 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  29.34 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  30.12 
 
 		 376 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>