More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1683 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  100 
 
 
382 aa  796    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  70.16 
 
 
382 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  70.16 
 
 
382 aa  579  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  41.82 
 
 
387 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.35 
 
 
384 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  42.55 
 
 
375 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  38.65 
 
 
389 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  38.2 
 
 
376 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  38.92 
 
 
389 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  39.19 
 
 
389 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  38.11 
 
 
389 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  40.05 
 
 
367 aa  255  8e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.21 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  38.82 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  38.82 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  39.08 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  38.96 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.96 
 
 
391 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.7 
 
 
391 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.96 
 
 
391 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  39.08 
 
 
366 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.96 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.7 
 
 
391 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.7 
 
 
391 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.22 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  38.66 
 
 
408 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.16 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.08 
 
 
389 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  35.97 
 
 
364 aa  226  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  36.19 
 
 
388 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.47 
 
 
391 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  34.39 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.5 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  33.85 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.97 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.62 
 
 
390 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  36.7 
 
 
380 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  35.26 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  37.87 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  37.77 
 
 
386 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.77 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  36.9 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.23 
 
 
389 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  36.24 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.95 
 
 
390 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.68 
 
 
376 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  34.21 
 
 
403 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  34.6 
 
 
373 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  34.04 
 
 
395 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.21 
 
 
403 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  34.32 
 
 
373 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  34.88 
 
 
373 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  33.69 
 
 
373 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.07 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  33.96 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  34.87 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  36.77 
 
 
380 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  33.86 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0203  alanine racemase  33.42 
 
 
365 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  34.93 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  33.51 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.8 
 
 
851 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  31.9 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.51 
 
 
379 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35 
 
 
382 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  31.03 
 
 
390 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.44 
 
 
374 aa  193  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.84 
 
 
387 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  34.32 
 
 
369 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  32.89 
 
 
395 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  30.38 
 
 
371 aa  190  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  32.55 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  34.38 
 
 
386 aa  189  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  32.61 
 
 
370 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  35.04 
 
 
366 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  35.01 
 
 
392 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.12 
 
 
380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  30.77 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  33.24 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  31.72 
 
 
382 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  32.72 
 
 
441 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  32.61 
 
 
374 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  32.15 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  32.15 
 
 
395 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  32.71 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  32.71 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  32.71 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  30.73 
 
 
370 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  33.06 
 
 
375 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  33.07 
 
 
379 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  31.73 
 
 
399 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  32.7 
 
 
368 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  33.07 
 
 
379 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>