More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0280 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  100 
 
 		 372 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  63.11 
 
 		 365 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  60.06 
 
 		 376 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  57.1 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  58.27 
 
 		 374 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  54.05 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  52.99 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  40.37 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  43.56 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  38.95 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.96 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  38.54 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  40.21 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.29 
 
 		 380 aa  236  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  38.29 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  39.2 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  38.17 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  38.16 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  38.25 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  38.74 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.16 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  38.19 
 
 		 379 aa  225  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  39.35 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  39.07 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  40.16 
 
 		 433 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  38.11 
 
 		 390 aa  222  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.9 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  38.8 
 
 		 386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.44 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  38.52 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.79 
 
 		 390 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.94 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.49 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  39.62 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.78 
 
 		 851 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  32.69 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  35.79 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.15 
 
 		 391 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.15 
 
 		 391 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  35.36 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  36.74 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.42 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.69 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.24 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.68 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.33 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  34.27 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  39.01 
 
 		 388 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.88 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.32 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  34.45 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.42 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.32 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  37.67 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.52 
 
 		 392 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.99 
 
 		 395 aa  205  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  36 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  37.6 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  34.88 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.7 
 
 		 411 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  35.48 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.15 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  38.12 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  37.95 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  37.57 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.94 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  34.84 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  37.43 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.82 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  35.26 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  31.87 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  38.3 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  34.89 
 
 		 369 aa  196  7e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.65 
 
 		 403 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  32.64 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.6 
 
 		 374 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  35.81 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  39.73 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  36.93 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.87 
 
 		 389 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  35.44 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.29 
 
 		 834 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  34.1 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  35.66 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  35.66 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  35.66 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  31.56 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  36.29 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  31.56 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.25 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  36.54 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.87 
 
 		 369 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.07 
 
 		 842 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  39.51 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  36.64 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  31.3 
 
 		 399 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  38.8 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  38.95 
 
 		 811 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  35.64 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>