More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0198 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  100 
 
 		 324 aa  655    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1008  alanine racemase  44.14 
 
 		 343 aa  259  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  41.07 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.73 
 
 		 364 aa  222  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  37.94 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.92 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.5 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  37.94 
 
 		 403 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  37.94 
 
 		 403 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  36.66 
 
 		 392 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.46 
 
 		 380 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  38.64 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.98 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.28 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  38.58 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.46 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.81 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  37.54 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  38.58 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  37.95 
 
 		 375 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  35.29 
 
 		 382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  37.54 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.09 
 
 		 395 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.39 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.36 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.87 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  38.58 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  37.54 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36.76 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  37.83 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  37.54 
 
 		 391 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  37.24 
 
 		 391 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  37.24 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  36.39 
 
 		 395 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  37.24 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  37.5 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  37.54 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  36.73 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  33.63 
 
 		 373 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  34.71 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  36.28 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  34.91 
 
 		 403 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  33.23 
 
 		 406 aa  188  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  36.44 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  34.91 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  35.63 
 
 		 369 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.05 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  34.29 
 
 		 390 aa  185  7e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.22 
 
 		 369 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  38.44 
 
 		 380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  36.36 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  37.35 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  37.04 
 
 		 378 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  35.38 
 
 		 379 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  35.57 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.04 
 
 		 851 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  33.43 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  33.43 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  35.63 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  32.15 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  34.13 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.66 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  35.09 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  31.33 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  33.73 
 
 		 380 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  31.33 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  34.53 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  32.75 
 
 		 811 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  32.94 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  32.23 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.13 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  35.28 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  31.74 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  32.52 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  34.32 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  33.53 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  33.43 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  36.83 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  34.69 
 
 		 399 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  34.3 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  32.34 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  30.84 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  33.53 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  31.45 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  33.43 
 
 		 378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  34.71 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  30.12 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0159  alanine racemase  34.82 
 
 		 372 aa  172  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  35.74 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  31.69 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00596  alanine racemase  33.43 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  33.33 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  31.85 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  32.34 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  33.33 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  32.84 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  33.03 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1380  alanine racemase  34.97 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000410979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  34.31 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  34.46 
 
 		 356 aa  169  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>