More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16471 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  100 
 
 
381 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  62.53 
 
 
398 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  58.51 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  58.62 
 
 
402 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  56.58 
 
 
376 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  56.53 
 
 
375 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  50.26 
 
 
399 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  49.6 
 
 
399 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  49.87 
 
 
399 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  48.81 
 
 
399 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  47.86 
 
 
406 aa  352  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  47.99 
 
 
395 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  47.21 
 
 
395 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  47.98 
 
 
403 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  46.51 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  46.51 
 
 
403 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  46.13 
 
 
387 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  45.21 
 
 
395 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  36.46 
 
 
390 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  35.87 
 
 
379 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.96 
 
 
421 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  36.98 
 
 
390 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  36.1 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  36.51 
 
 
392 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  37.47 
 
 
373 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  36.07 
 
 
434 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  38.26 
 
 
390 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.86 
 
 
373 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.13 
 
 
373 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.59 
 
 
373 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  34.42 
 
 
379 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.39 
 
 
389 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.69 
 
 
384 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  36.58 
 
 
441 aa  225  8e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.81 
 
 
390 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.51 
 
 
391 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.99 
 
 
378 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.24 
 
 
408 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  37.2 
 
 
370 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  36.94 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  33.97 
 
 
391 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.24 
 
 
391 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  34.24 
 
 
391 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.24 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.7 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  35.41 
 
 
398 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.03 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  38.17 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  34.33 
 
 
382 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.42 
 
 
391 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  36 
 
 
433 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.22 
 
 
376 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.51 
 
 
380 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  34.65 
 
 
377 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  37.37 
 
 
389 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  36.04 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  37.37 
 
 
389 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.05 
 
 
389 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  37.11 
 
 
389 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  36.83 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  33.86 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.6 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  37.91 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  36.07 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  33.95 
 
 
379 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.51 
 
 
391 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  33.52 
 
 
365 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  34.55 
 
 
374 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  37.9 
 
 
369 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  34.86 
 
 
371 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  39.52 
 
 
365 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.15 
 
 
379 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  36.64 
 
 
378 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  32.61 
 
 
366 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  37.4 
 
 
397 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  35.75 
 
 
389 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0198  alanine racemase  36.28 
 
 
324 aa  203  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  36.2 
 
 
410 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  37.3 
 
 
381 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.7 
 
 
378 aa  202  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.59 
 
 
386 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  36.36 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  36.36 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  36.36 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.85 
 
 
386 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  33.96 
 
 
386 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  35.29 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  33.42 
 
 
380 aa  199  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  34.7 
 
 
384 aa  199  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  38.46 
 
 
372 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  37.33 
 
 
811 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.81 
 
 
851 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>