More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1245 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  100 
 
 		 384 aa  790    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  52.24 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  49.47 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  45.1 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  39.42 
 
 		 392 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  41.01 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  39.68 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  39.42 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  39.58 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  39.63 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  38.1 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  38.1 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  38.62 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  38.36 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  38.36 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  38.36 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  38.1 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  38.99 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  38.26 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  39.42 
 
 		 408 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  37.57 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.31 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  36.51 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.7 
 
 		 395 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  37.99 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  37.77 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.8 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.2 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.37 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  40.42 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.13 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  37.18 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  37.18 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  37.18 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.29 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.23 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  36.92 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  36.67 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.04 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.1 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.11 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  38.36 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.32 
 
 		 377 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  37.53 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  36.15 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.7 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  36 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  35.64 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  36.34 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  36.94 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.5 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  36.43 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.04 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.48 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.88 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.44 
 
 		 390 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.95 
 
 		 380 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  36.8 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.73 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.86 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.93 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  36.84 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  36.72 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  36.55 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  36.29 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  35.82 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  37.4 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  35.66 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  32.72 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  34.95 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  36.06 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  39.33 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.47 
 
 		 851 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  34.66 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.88 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.55 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  34.93 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  36.8 
 
 		 811 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  34.95 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  33.59 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  33.16 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  33.69 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  33.16 
 
 		 842 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.33 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  34.7 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.07 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  35.96 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  32.89 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  31.28 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.16 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  35.88 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  32.4 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  31.15 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.74 
 
 		 834 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.69 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  34.04 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>