More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1563 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  690    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  83.63 
 
 
391 aa  696    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  100 
 
 
392 aa  808    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  82.1 
 
 
391 aa  686    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  81.84 
 
 
391 aa  685    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  82.86 
 
 
391 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  82.61 
 
 
408 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  60.36 
 
 
398 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  44.65 
 
 
390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  44.17 
 
 
373 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  47.67 
 
 
373 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  47.95 
 
 
370 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  44.94 
 
 
389 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  44.15 
 
 
379 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  44.62 
 
 
373 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  45.08 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  47.12 
 
 
373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  46.03 
 
 
373 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  43.85 
 
 
391 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  44.33 
 
 
389 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  45.57 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  45.31 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  44.39 
 
 
380 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  43.6 
 
 
390 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  44.59 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  44.85 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  42.89 
 
 
387 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  41.71 
 
 
377 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  44.3 
 
 
389 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.78 
 
 
390 aa  315  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  315  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  44.99 
 
 
380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  44.04 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.21 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  38.5 
 
 
379 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.15 
 
 
384 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  40.33 
 
 
851 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  42.86 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  39.38 
 
 
390 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  38.5 
 
 
384 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.66 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  39.57 
 
 
370 aa  281  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  40.59 
 
 
369 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  38.34 
 
 
433 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  38.13 
 
 
395 aa  279  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  37 
 
 
382 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.76 
 
 
811 aa  277  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.31 
 
 
380 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  40.55 
 
 
403 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  39.42 
 
 
384 aa  275  8e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  39.45 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.74 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  39.57 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  38.99 
 
 
421 aa  272  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  40.85 
 
 
379 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  40.58 
 
 
379 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  37.7 
 
 
395 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  40.05 
 
 
375 aa  270  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.5 
 
 
441 aa  269  8e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  38.83 
 
 
434 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  38.57 
 
 
375 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  37.03 
 
 
378 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.25 
 
 
406 aa  265  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.78 
 
 
376 aa  262  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  39.95 
 
 
364 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  37.33 
 
 
379 aa  260  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  38.2 
 
 
388 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  40.16 
 
 
367 aa  256  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  40.21 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  38.32 
 
 
376 aa  254  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  39.2 
 
 
367 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  40.2 
 
 
382 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  40.2 
 
 
382 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  38.79 
 
 
373 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  40.43 
 
 
844 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  39.41 
 
 
849 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  36.15 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.01 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  34.74 
 
 
395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.21 
 
 
395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  41.19 
 
 
365 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  34.47 
 
 
395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  36.91 
 
 
393 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  40.32 
 
 
366 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  35.53 
 
 
395 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  36.96 
 
 
398 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  35.85 
 
 
369 aa  235  9e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  36.87 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  36.66 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  35.71 
 
 
376 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>