More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2180 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  100 
 
 		 371 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  59.24 
 
 		 386 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  55.46 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  52.19 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  51.64 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  54.05 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  51.37 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  40.43 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  42.12 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  39.73 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  37.94 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  37.8 
 
 		 370 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  39.57 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  39.3 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.32 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.14 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  38.54 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  37.17 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.87 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  39.02 
 
 		 369 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  38.07 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  38.07 
 
 		 379 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  37.67 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.53 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.97 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  39.19 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.77 
 
 		 373 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  39.67 
 
 		 382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.36 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  34.52 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.57 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.56 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.99 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  37.85 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  34.32 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.86 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.83 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  37.43 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  37.43 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  36.91 
 
 		 371 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.56 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  33.24 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  33.52 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  34.86 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  35.08 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  36.24 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  33.88 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  32.8 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  32.69 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  34.78 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.7 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  36.39 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  33.42 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  36.6 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  33.42 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  32.97 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  35.42 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  34.83 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  33.51 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  33.87 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  33.15 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  32.97 
 
 		 389 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  34.5 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.7 
 
 		 392 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0933  alanine racemase  35.34 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  34.68 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  31.71 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  32.78 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  33.79 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  31.71 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  33.24 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  34.29 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  35.28 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  31 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.76 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.14 
 
 		 834 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  33.52 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  35.03 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.85 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.43 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  34.32 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  36.34 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.29 
 
 		 851 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  31.3 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  31.3 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  31.58 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  36.34 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2441  alanine racemase  33.97 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2818  alanine racemase  33.97 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3724  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  32.4 
 
 		 842 aa  182  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  37.79 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  34.84 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.3 
 
 		 391 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  35.59 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  35.59 
 
 		 384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  33.96 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  31.22 
 
 		 408 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>